Organik va noorganik pigmentlar kelib chiqishi va kimyoviy xossalariga ko'ra farqlanadi.
Manba: Organik pigmentlar hayvonlar, o'simliklar, minerallar yoki sun'iy ravishda sintez qilingan organik birikmalardan olinadi yoki sintezlanadi. Noorganik pigmentlar rudalardan, minerallardan yoki sintetik noorganik birikmalardan olinadi yoki sintezlanadi.
Kimyoviy xususiyatlar: Organik pigmentlarning molekulalari odatda uglerodni o'z ichiga olgan murakkab tuzilmalardan iborat bo'lib, ularning rangi organik birikmaning kimyoviy tuzilishi bilan belgilanadi. Noorganik pigmentlarning molekulalari odatda noorganik elementlardan iborat bo'lib, ularning rangi elementlarning xususiyatlari va tuzilishi bilan belgilanadi.
Barqarorlik: noorganik pigmentlar odatda organik pigmentlarga qaraganda ancha barqaror va yorug'lik, kislota, gidroksidi va issiqlikka nisbatan ancha chidamli. Organik pigmentlar ma'lum sharoitlarda parchalanishi yoki rangini o'zgartirishi mumkin. Rang diapazoni: kimyoviy tuzilishidagi farqlar tufayli organik pigmentlar odatda kengroq rang diapazoniga ega bo'lib, yanada jonli ranglarga imkon beradi. Noorganik pigmentlar nisbatan tor rang diapazoniga ega. Qo'llash sohalari: Organik pigmentlar bo'yoqlar, bo'yoqlar, plastmassalar, qog'oz va boshqa sohalar uchun javob beradi. Noorganik pigmentlar keramika, shisha, pigmentlar, qoplamalar va boshqa sohalarda keng qo'llaniladi.

Shuni ta'kidlash kerakki, organik va noorganik pigmentlarning o'ziga xos afzalliklari va xususiyatlari bor va qaysi pigmentni tanlash maxsus dastur ehtiyojlariga va kerakli effektga bog'liq.